Joker Helix, l'un des six généraux galactiques, a attaqué Mother Ether. L'Edens Zero, bien qu'il doive faire face à ses attaques de manipulation temporelle, parvient à se sortir de ce mauvais pas grâce aux connaissances du vieux Wise et à l'ingéniosité de Rebecca. La route vers Mother s'ouvre enf...