A l'approche de la remise des diplômes, Amu doit faire face à de nombreux bouleversements, à commencer par la disparition de Ran, Miki et Sû. Heureusement, Dia, qui se dit être la "navigatrice de son futur" , va la guider à travers un voyage spatiotemporel à la recherche de ses chara... et d'elle...